南京医科大学附属逸夫医院消化科是医院重点建设科室，是江苏省食管疾病规范诊治联盟单位和江苏省炎症性肠病专科联盟单位。设有消化内科门诊、消化内科病房、消化内镜中心、消化实验室。在逸夫医院党委书记、江苏省人民医院内镜中心主任朱宏主任医师带领下，科室人才及技术力量雄厚，现有医生14人，其中副教授3人，硕士生导师2人。博士及在读博士6名，硕士8名。主任医师5名，副主任医师2名，主治医师5名，住院医师2名。特聘江苏省人民医院消化科徐顺福主任医师及内镜中心于莲珍主任医师长期坐诊。
消化内科门诊（普通及专家门诊）全年无休开诊，年门诊人次约五万人次。另开设两个专病门诊：周一下午炎症性肠病专病门诊，周三下午幽门螺杆菌感染专病门诊。
消化内科病房开放床位47张，年住院人次近三千人。常规收治消化系统常见病、少见病及疑难危重病例。对难治性幽门螺杆菌感染性疾病、难治性炎症性肠病、重症胰腺炎、重症胆管炎、消化道大出血、肝硬化、消化道肿瘤等疾病的诊治具有丰富经验。依托中华粪菌库，对肠道微生态疾病的粪菌移植治疗达到国内先进水平。
消化内镜中心设备齐全，年诊治人次约1.5万人。拥有最先进的日本奥林巴斯290内镜主机系统（包括胃镜、肠镜、放大染色内镜、十二指肠镜、小肠镜、经口胆道镜）、线阵超声内镜及规范的内镜消毒及清洗系统。配备飞利浦ERCP X光机及胃肠动力检查及治疗设备。在超级微创医疗理念的指导下，在江宁地区率先独立开展多项内镜下超级微创手术，使得老百姓不出江宁就能获得国内高水平内镜微创技术的诊治。特色超级微创内镜技术包括：无痛胃肠镜检查、儿童消化道胃肠镜检查、消化道早期肿瘤的放大及染色内镜检查、消化道异物的24小时取出术、消化道出血的内镜下止血术、消化道梗阻的内镜下扩张及支架植入术、胃肠道息肉及早癌的内镜下切除术（EMR、ESD）、粘膜下肿瘤隧道内镜挖除术(STER)、贲门失弛缓内镜下肌切开术(POEM)、胰腺疾病的超声内镜检查及超声穿刺术（EUS-FNA/B）、内镜逆行胰胆管造影术（ERCP）诊治胆总管结石、胆管癌、胰腺癌、慢性胰腺炎等、痔疮的内镜下套扎及硬化治疗术（CAES）、阑尾粪石的内镜下取出术（ERAT）等。