肾脏内科是南京医科大学校级重点专科、南京医科大学内科学（肾脏内科）博士培养点，承担博士后、专业及科学学位研究生的培养和教学任务，也是我院重点发展科室。科室包括肾脏内科专科门诊、肾脏病专科病房、血液净化中心、腹膜透析中心和肾脏病专科实验室等部门，拥有一支以首批“江苏省肾科医学领军人才”曹长春教授为学科带头人、以“南京市五一巾帼标兵”李汶汶主任为学科骨干的团队，现有核定床位22张、血液透析机位58个、连续性肾替代治疗机8台、自动化腹膜透析机3台。
肾脏内科以临床需求为导向，凝练了以急性肾损伤的早期监测与干预、慢性肾脏病的一体化治疗、透析通路的建立与维护、甲状旁腺功能亢进症的综合诊治和肾替代治疗的智能化管理为特色技术及学科方向，保持了与国内外同行发展相一致的步伐，是一个临床诊疗规范、科研教学全面推进的成长型科室，可实现对肾脏内科全病种的规范化诊治并可提供全面的血液净化技术。科室先后获得江苏省医学新技术引进奖、江苏医学科技奖、南京市科学技术进步奖等多项荣誉，获批国家自然科学基金8项、国家级课题1项、省级课题5项。